负责农业科技、生物技术、地球与资源、大气海洋科学与生态环境等领域的学科建设、发展规划、科研平台建设与管理，相关领域重大科技任务的培育、争取、组织、协调与管理；负责与地方科技合作的组织协调，促进科技成果转移转化；负责知识产权管理；负责植物园、标本馆、野外台站的管理工作等。
设置7个处室：综合业务处、农业科技办公室、生物技术处、地球与资源处、大气海洋与生态环境处、科技合作处、知识产权管理处。
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